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Title: Molecular dynamics and docking simulations of the ADP/ATP mitochondrial carrier: structural-dynamical insights for the inactivation of pathological mutants and detection of potential ATP binding sites
Authors: Falconi, Mattia
Di Marino, Daniele
Keywords: molecular dynamics
membrane proteins
adp/atp mitochondrial carrier
molecular docking
Issue Date: 13-Jan-2010
Abstract: Il carrier mitocondriale ADP/ATP (AAC) è stato cristallizato in complesso con il suo inibitore carboxyatractyloside (CATR). La proteina è composta da un fascio di sei eliche trans membrana che forma un canale all'interno della membrane mitocondriale interna che si presenta chiuso verso il lato matriciale ed aperto verso lo spazio intermembrana, conformazione dovuta alla presenza di una prolina sulle eliche dispari che forma una piegatura dell'€™elica. Il ruolo di questa proteina è di importare ADP nella matrice mitocondriale ed esportare ATP nel citosol. L'€™insorgenza di alcune patologie è stata associata ad un malfunzionamento di questa proteina. Al fine di capire meglio le proprietà dinamico/strutturali del trasportatore sono stati eseguiti due diversi esperimenti computazionali, per analizzare sia il meccanismo di trasporto che il ruolo di determinate mutazioni patologiche. In un primo esperimento sono state condotte tre simulazioni di Dinamica Molecolare di 20 ns della protein w...
Description: 22. ciclo
URI: http://hdl.handle.net/2108/1174
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